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Table 3.

Consensus sequence motif within 2 kb upstream of SPCGs

Consensus
GeneSequenceDistance from ORF
srp9 T G A C G T T G A <100 bp 
srp68 C G A C G T G T A <100 bp 
 T G A C G T G G T  
srp72 T G A C G T T G A  
srp54 C G A C G T G T C <200 bp 
 C G A C G T G G A <200 bp 
srp14 G G A C G T G T T  
srp19 No site within 2 kb  
srpRα T G A C G T G G A <100 bp 
srpRβ C C A C G T T G C  
 C G A C G T T G T  
sec61α T G A C G T T T C <200 bp 
 C G A C G T G T C <200 bp 
sec61β T G A C G T G G A <200 bp 
 T G A C G T G C T <100 bp 
sec61γ T G A C G T T G C <100 bp 
 C G A C G T G G C <100 bp 
 C G A C G T G G A ∼500 bp 
sec62 No site within 2 kb  
sec63 C T A C G T G T C <500 bp 
 T G A C G T T C T  
sec71 G G A C G T T C T  
tram C G A C G T T C A <200 bp 
trapδ T G A C G T G A C <200 bp 
spase22/23 C G A C G T G T C <100 bp 
spase 12 T G A C G T G C C <100 bp 
spase18/21 A T A C G T G T C <200 bp 
spase 25 T G A C G T T T C <500 bp 
 G G A C G T G G A  
chop24 C T A C G T G C T <100 bp 
p24-rel1 T G A C G T G T T <200 bp 
 T G A C G T G T C <500 bp 
p24-rel2 T G A C G T G T C <100 bp 
sec31 G G A C G T G A C <100 bp 
 T G A C G T G C G  
 G G A C G T G T A  
 T G A C G T T T A  
sec13 T G A C G T G G A <100 bp 
sec23 T G A C G T G G C <100 bp 
sec24 T G A C G T G C C  
 G G A C G T G T T  
sar1 C T A C G T G G T ∼500 bp 
 C T A C G T G G A  
arf79F C T A C G T G T A  
 G G A C G T G T A  
δ-Cop T G A C G T T T T <100 bp 
 T G A C G T G T T <200 bp 
γ-Cop T G A C G T G A A <500 bp 
ζ-Cop T G A C G T G T A <100 bp 
 T G A C G T T G G <500 bp 
ϵ-Cop C T A C G T G G T  
erd2 T G A C G T G G C <500 bp 
Consensus
GeneSequenceDistance from ORF
srp9 T G A C G T T G A <100 bp 
srp68 C G A C G T G T A <100 bp 
 T G A C G T G G T  
srp72 T G A C G T T G A  
srp54 C G A C G T G T C <200 bp 
 C G A C G T G G A <200 bp 
srp14 G G A C G T G T T  
srp19 No site within 2 kb  
srpRα T G A C G T G G A <100 bp 
srpRβ C C A C G T T G C  
 C G A C G T T G T  
sec61α T G A C G T T T C <200 bp 
 C G A C G T G T C <200 bp 
sec61β T G A C G T G G A <200 bp 
 T G A C G T G C T <100 bp 
sec61γ T G A C G T T G C <100 bp 
 C G A C G T G G C <100 bp 
 C G A C G T G G A ∼500 bp 
sec62 No site within 2 kb  
sec63 C T A C G T G T C <500 bp 
 T G A C G T T C T  
sec71 G G A C G T T C T  
tram C G A C G T T C A <200 bp 
trapδ T G A C G T G A C <200 bp 
spase22/23 C G A C G T G T C <100 bp 
spase 12 T G A C G T G C C <100 bp 
spase18/21 A T A C G T G T C <200 bp 
spase 25 T G A C G T T T C <500 bp 
 G G A C G T G G A  
chop24 C T A C G T G C T <100 bp 
p24-rel1 T G A C G T G T T <200 bp 
 T G A C G T G T C <500 bp 
p24-rel2 T G A C G T G T C <100 bp 
sec31 G G A C G T G A C <100 bp 
 T G A C G T G C G  
 G G A C G T G T A  
 T G A C G T T T A  
sec13 T G A C G T G G A <100 bp 
sec23 T G A C G T G G C <100 bp 
sec24 T G A C G T G C C  
 G G A C G T G T T  
sar1 C T A C G T G G T ∼500 bp 
 C T A C G T G G A  
arf79F C T A C G T G T A  
 G G A C G T G T A  
δ-Cop T G A C G T T T T <100 bp 
 T G A C G T G T T <200 bp 
γ-Cop T G A C G T G A A <500 bp 
ζ-Cop T G A C G T G T A <100 bp 
 T G A C G T T G G <500 bp 
ϵ-Cop C T A C G T G G T  
erd2 T G A C G T G G C <500 bp 
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