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Table 1.

Primers and probes used in digoxigenin (DIG) PCR probe labelling and real-time RT–PCR (TaqMan assays)

MethodPrimerOligonucleotidesConcentration (nmol l-1)Amplicon (bp)
DIG PCR probe labelling Luc 1 Forward 5′-caaatcattccggatactgcg-3′ 400 397 
  Reverse 5′-cccggtttatcatccccct-3′ 400  
Real-time PCR assays Luc 2 Forward 5′-tgggctcactgagactacatca-3′ 900 64 
  Reverse 5′-cgcgcccggtttatcatc-3′ 900  
  Probe FAM-tcgggtgtaatcagaatag 250  
Real-time PCR assays 18S Forward 5′-gccctgtaattggaatgagtgtact-3′ 900 101 
  Reverse 5′-acgctattggagctggaattacc-3′ 900  
  Probe FAM-cttgccctccaattgg 250  
MethodPrimerOligonucleotidesConcentration (nmol l-1)Amplicon (bp)
DIG PCR probe labelling Luc 1 Forward 5′-caaatcattccggatactgcg-3′ 400 397 
  Reverse 5′-cccggtttatcatccccct-3′ 400  
Real-time PCR assays Luc 2 Forward 5′-tgggctcactgagactacatca-3′ 900 64 
  Reverse 5′-cgcgcccggtttatcatc-3′ 900  
  Probe FAM-tcgggtgtaatcagaatag 250  
Real-time PCR assays 18S Forward 5′-gccctgtaattggaatgagtgtact-3′ 900 101 
  Reverse 5′-acgctattggagctggaattacc-3′ 900  
  Probe FAM-cttgccctccaattgg 250  
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