Table 2.

Analysis of the genes identified by microarray experiments

Accession number
Log2 (sample/control)
GeneX. tropicalisX. laevisMicroarrayRT-PCRArray and RT-PCRCategory
ELAVL3 NM_001030326 U17598 −3.040 −3.435 + 1 
SP5 CT025179 AY062264 −2.963 −2.582 + 1 
KRT24 CX745012 BC043901 −2.862 −4.071 + 1 
MX11 CR942348 DQ104100 −2.662 N.D. − N.D. 
TRIM29 CR926196 BC044714 −2.572 −2.620 + 1 
Unknown 43 CT485755 BC045031 −2.552 −2.321 + 2 
SOX2 CR760314 AF005476 −2.453 −2.293 + 1 
Epiplakin 1 No homology BC082957 −2.315 −2.366 + N.D. 
KIAA1324L CT025403 BC077391 −2.303 −3.308 + 1 
Unknown BX689202 AJ009297 −2.277 −1.371 + N.D. 
cyclin D1 BQ522031 BC041525 −2.247 −1.944 + 1 
cyclin D1 BQ522031 BC106631 −2.021 −2.260 + N.D. 
SLC2A2 CT030568 BC070704 −1.899 −1.703 + 1 
Cerberus NM_203515 BC081277 −1.897 −2.308 + 1 
DLX6 CX836573 D10259 −1.876 −1.677 + 1 
DHRS3 CR848157 BC073416 −1.860 −1.534 + 3 
HTRA1 BC073416 BC087471 −1.853 −3.231 + 1 
NUDT22 CR942377 BC068937 −1.827 −1.657 + 1 
TFAP2A CR848274 M59455 −1.799 −1.689 + 1 
Unknown 122 CX516192 AJ009297 −1.761 −1.936 + 1 
Claudin 4 NM_001016663 BC099009 −1.759 −1.518 + 1 
ATP2A2 DT418145 BC098958 −1.709 −0.466 − 1 
SLC2A2 CT030568 BC070704 −1.706 −1.550 + N.D. 
GATA6 CT030595 BC082349 −1.667 −1.815 + 1 
NGFR BQ393897 BC068640 −1.657 −1.071 + 1 
PTAFR No homology BC046657 −1.656 −1.179 + 1 
MEIS1 CR760178 BC084920 −1.604 −1.418 + 1 
DYNLL1 CR761866 BC073042 −1.603 −1.619 + 3 
ROR2 CF219705 AB087137 −1.592 −1.781 + 1 
SALL1 No homology BC059284 −1.572 −1.167 + 1 
PDCD4 CF151949 BC056125 −1.572 −1.264 + 4 
IER5L CX363316 BC081197 −1.559 −0.368 − 1 
Unknown NM_001016654 BC110732 −1.520 −1.332 + N.D. 
ZNF503 CF219041 BC046863 −1.512 −1.034 + N.D. 
EFS CR761735 BC084637 −1.494 −0.416 − 4 
SRFP2 CR761702 AF059570 −1.478 −1.446 + 3 
PDGFRA CR761598 M80798 −1.463 −1.656 + 1 
LRRN1 CX374253 AB014462 −1.438 −1.597 + 1 
IGSF4 DR833927 BC108832 −1.435 0.313 − 4 
LMO3 CX874767 BC106431 −1.413 −3.157 + 1 
ZFHX1B DT447181 BC084972 −1.413 −0.640 − 1 
CYP26A1 NM_001016147 BC073518 −1.394 −0.918 − 4 
Cadherin 1 CF217799 L29057 −1.382 −1.296 + 1 
Xiro1 DT434125 AJ001834 −1.370 −1.289 + 1 
STAG2 BX775788 AF255018 −1.349 −0.609 − 1 
SALL1 CX490174 AF310007 −1.336 −1.465 + N.D. 
GATA4 NM_001016949 DQ096869 −1.334 −1.136 + 1 
RBM12 DN075293 BC059291 −1.325 −0.981 − 1 
HNRPU CR855462 BC046700 −1.319 −1.617 + 1 
MGC61598 CX372678 BC084778 −1.316 −1.285 + 1 
Unknown 115 No homology X92851 −1.276 −1.093 + 1 
POLE3 NM_001017264 AY271302 −1.264 −1.018 + 4 
OSR2 DN038055 BC108579 −1.239 −1.278 + 1 
ALCAM AL797115 BC074313 −1.229 −0.776 − 1 
HUNK CX465369 AY318878 −1.198 −1.228 + 1 
ZFP36L1 CT025463 BC100162 −1.188 −0.059 − 4 
GATA3 CF221701 BC110754 −1.159 −1.850 + 1 
P4HB BX695354 BC077772 −1.144 −0.897 − 4 
BTG1 BQ526679 BC090221 −1.142 −0.865 − 4 
Unknown 132 CF241734 BC108804 −1.140 −0.260 − 1 
RBM5 NM_001017278 BC077408 −1.090 −0.874 − 4 
H2BFS NM_001017251 X03018 −1.015 −0.465 − 1 
FBXO43 CT010561 AF176353 2.366 3.130 + 2 
YWHAH CR848634 BC075238 2.066 −0.259 − 4 
cyclin B1 DT407498 AJ304991 2.043 1.157 + 2 
Unknown BX772260 No homology 2.020 N.D. − N.D. 
WDR20 CR848483 BC070814 1.963 2.165 + 2 
CEPB1 NM_001017330 BC077702 1.869 2.074 + 2 
VLDLR CR760336 AB006906 1.759 1.684 + 2 
FOXI1 BQ393881 BC042303 1.733 1.112 + 4 
BTG4 CR761158 BC088789 1.609 2.228 + 2 
CSNK1E CF376118 AF183394 1.601 1.381 + 2 
RBP1 CN076203 BC068742 1.508 1.669 + 2 
Unknown CR760615 No homology 1.507 N.D. − N.D. 
LOC494796 CF591895 BC082922 1.499 1.037 + 4 
Unknown CX899957;CX899956 No homology 1.453 N.D. − N.D. 
RPN2 CR848133 BC046727 1.440 0.626 − 4 
Unknown CR761187 BC097911 1.435 2.080 + 2 
PGK2 NM_001016545 BC077781 1.415 1.299 + 2 
Unknown CX807382 No homology 1.407 N.D. − N.D. 
C15ORF20 NM_001016603 BC097805 1.344 1.629 + 2 
Unknown CR760587 No homology 1.328 N.D. − N.D. 
Unknown No homology No homology 1.307 N.D. − N.D. 
Unknown CR848499 No homology 1.306 N.D. − N.D. 
SYTL2 CF781991 BC082628 1.258 1.098 + 2 
ECT2 DN094916 AY487422 1.239 2.016 + 2 
MCM10 CR848457 BC070548 1.235 1.779 + 2 
KCTD14 CT025440 BC068871 1.231 1.772 + 2 
Unknown DN096278 No homology 1.228 N.D. − N.D. 
Unknown CT025176 No homology 1.226 0.287 − N.D. 
PI4K2B NM_001016953 BC077943 1.220 1.055 + 2 
Unknown No homology No homology 1.178 N.D. − N.D. 
FBXO33 CT027881 BC099041 1.177 1.057 + 2 
VRK1 CR761062 BC054213 1.100 1.283 + 2 
TNRC17 DR841565 BC070738 1.017 0.857 − 4 
Accession number
Log2 (sample/control)
GeneX. tropicalisX. laevisMicroarrayRT-PCRArray and RT-PCRCategory
ELAVL3 NM_001030326 U17598 −3.040 −3.435 + 1 
SP5 CT025179 AY062264 −2.963 −2.582 + 1 
KRT24 CX745012 BC043901 −2.862 −4.071 + 1 
MX11 CR942348 DQ104100 −2.662 N.D. − N.D. 
TRIM29 CR926196 BC044714 −2.572 −2.620 + 1 
Unknown 43 CT485755 BC045031 −2.552 −2.321 + 2 
SOX2 CR760314 AF005476 −2.453 −2.293 + 1 
Epiplakin 1 No homology BC082957 −2.315 −2.366 + N.D. 
KIAA1324L CT025403 BC077391 −2.303 −3.308 + 1 
Unknown BX689202 AJ009297 −2.277 −1.371 + N.D. 
cyclin D1 BQ522031 BC041525 −2.247 −1.944 + 1 
cyclin D1 BQ522031 BC106631 −2.021 −2.260 + N.D. 
SLC2A2 CT030568 BC070704 −1.899 −1.703 + 1 
Cerberus NM_203515 BC081277 −1.897 −2.308 + 1 
DLX6 CX836573 D10259 −1.876 −1.677 + 1 
DHRS3 CR848157 BC073416 −1.860 −1.534 + 3 
HTRA1 BC073416 BC087471 −1.853 −3.231 + 1 
NUDT22 CR942377 BC068937 −1.827 −1.657 + 1 
TFAP2A CR848274 M59455 −1.799 −1.689 + 1 
Unknown 122 CX516192 AJ009297 −1.761 −1.936 + 1 
Claudin 4 NM_001016663 BC099009 −1.759 −1.518 + 1 
ATP2A2 DT418145 BC098958 −1.709 −0.466 − 1 
SLC2A2 CT030568 BC070704 −1.706 −1.550 + N.D. 
GATA6 CT030595 BC082349 −1.667 −1.815 + 1 
NGFR BQ393897 BC068640 −1.657 −1.071 + 1 
PTAFR No homology BC046657 −1.656 −1.179 + 1 
MEIS1 CR760178 BC084920 −1.604 −1.418 + 1 
DYNLL1 CR761866 BC073042 −1.603 −1.619 + 3 
ROR2 CF219705 AB087137 −1.592 −1.781 + 1 
SALL1 No homology BC059284 −1.572 −1.167 + 1 
PDCD4 CF151949 BC056125 −1.572 −1.264 + 4 
IER5L CX363316 BC081197 −1.559 −0.368 − 1 
Unknown NM_001016654 BC110732 −1.520 −1.332 + N.D. 
ZNF503 CF219041 BC046863 −1.512 −1.034 + N.D. 
EFS CR761735 BC084637 −1.494 −0.416 − 4 
SRFP2 CR761702 AF059570 −1.478 −1.446 + 3 
PDGFRA CR761598 M80798 −1.463 −1.656 + 1 
LRRN1 CX374253 AB014462 −1.438 −1.597 + 1 
IGSF4 DR833927 BC108832 −1.435 0.313 − 4 
LMO3 CX874767 BC106431 −1.413 −3.157 + 1 
ZFHX1B DT447181 BC084972 −1.413 −0.640 − 1 
CYP26A1 NM_001016147 BC073518 −1.394 −0.918 − 4 
Cadherin 1 CF217799 L29057 −1.382 −1.296 + 1 
Xiro1 DT434125 AJ001834 −1.370 −1.289 + 1 
STAG2 BX775788 AF255018 −1.349 −0.609 − 1 
SALL1 CX490174 AF310007 −1.336 −1.465 + N.D. 
GATA4 NM_001016949 DQ096869 −1.334 −1.136 + 1 
RBM12 DN075293 BC059291 −1.325 −0.981 − 1 
HNRPU CR855462 BC046700 −1.319 −1.617 + 1 
MGC61598 CX372678 BC084778 −1.316 −1.285 + 1 
Unknown 115 No homology X92851 −1.276 −1.093 + 1 
POLE3 NM_001017264 AY271302 −1.264 −1.018 + 4 
OSR2 DN038055 BC108579 −1.239 −1.278 + 1 
ALCAM AL797115 BC074313 −1.229 −0.776 − 1 
HUNK CX465369 AY318878 −1.198 −1.228 + 1 
ZFP36L1 CT025463 BC100162 −1.188 −0.059 − 4 
GATA3 CF221701 BC110754 −1.159 −1.850 + 1 
P4HB BX695354 BC077772 −1.144 −0.897 − 4 
BTG1 BQ526679 BC090221 −1.142 −0.865 − 4 
Unknown 132 CF241734 BC108804 −1.140 −0.260 − 1 
RBM5 NM_001017278 BC077408 −1.090 −0.874 − 4 
H2BFS NM_001017251 X03018 −1.015 −0.465 − 1 
FBXO43 CT010561 AF176353 2.366 3.130 + 2 
YWHAH CR848634 BC075238 2.066 −0.259 − 4 
cyclin B1 DT407498 AJ304991 2.043 1.157 + 2 
Unknown BX772260 No homology 2.020 N.D. − N.D. 
WDR20 CR848483 BC070814 1.963 2.165 + 2 
CEPB1 NM_001017330 BC077702 1.869 2.074 + 2 
VLDLR CR760336 AB006906 1.759 1.684 + 2 
FOXI1 BQ393881 BC042303 1.733 1.112 + 4 
BTG4 CR761158 BC088789 1.609 2.228 + 2 
CSNK1E CF376118 AF183394 1.601 1.381 + 2 
RBP1 CN076203 BC068742 1.508 1.669 + 2 
Unknown CR760615 No homology 1.507 N.D. − N.D. 
LOC494796 CF591895 BC082922 1.499 1.037 + 4 
Unknown CX899957;CX899956 No homology 1.453 N.D. − N.D. 
RPN2 CR848133 BC046727 1.440 0.626 − 4 
Unknown CR761187 BC097911 1.435 2.080 + 2 
PGK2 NM_001016545 BC077781 1.415 1.299 + 2 
Unknown CX807382 No homology 1.407 N.D. − N.D. 
C15ORF20 NM_001016603 BC097805 1.344 1.629 + 2 
Unknown CR760587 No homology 1.328 N.D. − N.D. 
Unknown No homology No homology 1.307 N.D. − N.D. 
Unknown CR848499 No homology 1.306 N.D. − N.D. 
SYTL2 CF781991 BC082628 1.258 1.098 + 2 
ECT2 DN094916 AY487422 1.239 2.016 + 2 
MCM10 CR848457 BC070548 1.235 1.779 + 2 
KCTD14 CT025440 BC068871 1.231 1.772 + 2 
Unknown DN096278 No homology 1.228 N.D. − N.D. 
Unknown CT025176 No homology 1.226 0.287 − N.D. 
PI4K2B NM_001016953 BC077943 1.220 1.055 + 2 
Unknown No homology No homology 1.178 N.D. − N.D. 
FBXO33 CT027881 BC099041 1.177 1.057 + 2 
VRK1 CR761062 BC054213 1.100 1.283 + 2 
TNRC17 DR841565 BC070738 1.017 0.857 − 4 

N.D., not determined.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal