Skip to Main Content
Table 1.

Expression of marker genes specific for NB subsets in wt, vndloss-of-function (vnd-) and gain-of-function (sca-vnd)embryos at stage 11

Wild type*
vnd-
sca-vnd
divd%i%v%d%i%v%
Msh  − −     Dv2 23   −  −  
        Dv3 82       
        Dv4 35       
        Dv5 15       
 Dd2-13   Dd2-13 100 Dd1 91 Dv6 80 Dd2-13 0     
        Dv7 9       
        Dv8 30       
 Td4-8   Td4-8 100 Td2 75 Tv1,4 5 Td4-8 0     
        Tv2 25       
        Tv3 15       
        Tv5 30       
ind − (Ppd6,9,13 Pcd7,13) − −  (Ppd6,9,13 Pcd7,13) All 100 −  −  2-3 PCNBs  −  
  Dd1    Dd1 0     Dd1 92   
  Td1-3    Td1,2 0     Td1-3 0   
      Td3 85         
Ey Pad7  Pcv6 Pad7    Pcv6 55 Pad7    Pcv6 100 
 Pcd2,14  Pcv7 Pcd2,14    Pcv7 95 Pcd2,14    Pcv7 100 
 Ppd12,18,  Pcv9 Ppd12,18,    Pcv9 100 Pcd12,18,20    Pcv9 100 
 20  Ppv2 20    Ppv2 35     Ppv2 55 
 Dd4 Td1 Dv6 Dd4  Td1 0 Dv6 0 Dd4  Td1 0 Dv6 100 
  Td2 Dv7  All 100 Td2 40 Dv7 10  All <5 Td2 0 Dv7 20 
Dac Pcd1,2,4, − Pav1 Pcd1,2,4,  −  Pav1 100 Pcd1,2,4,  −  Pav1 40 
 6,8,9,14  Pcv7 6,8,9,14    Pcv7,9 100 6,8,9,14 <20   Pcv7 100 
 Ppd1,9,11  Pcv9 Ppd1,9,11    2-4 PCNBs  Ppd1,9,11 <20   Pcv9 100 
   Tv2  All 100   Tv2 25 Pcd2 100   Tv2 95 
Ems Ppd2,5,8 − Pcv5 Ppd2,5,8    Pcv5 15 Ppd2 30 −  Pcv5 88 
          Ppd5 0     
          Ppd8 20     
 Dd3,6,8  Dv3 Dd3,6,8  Dd1 80 Dv3 85 Dd3 12   Dv3 100 
        Dv2 20 Dd6 87     
    Td6    Dv6 70 Dd8 92     
 Td6    All 100   Tv2 25 Td6 0     
Lbe  − Pcv8   −  Pcv8 0 1-6 PCNBs  −  Pcv8 100 
 Dd7  Ppv3 Dd7    Ppv3 0 Dd7 40   Ppv3 100 
 Td4   Td4 All 100     Td4 0     
En Ppd5,8  Dv8 Ppd5,8    Dv8 30 Ppd5 75     
 Dd5  Tv4,5 Dd5    Tv4 5 Ppd8 30     
 Td5 Td3  Td5  Td3 90 Tv5 30 Dd5 25   Dv8 75 
     All 100     Td5 100 Td3 100 Tv4,5 100 
Gsb-d Ppd3,10   Ppd3,10      n.d.  n.d.  n.d.  
 Dd5,7   Dd5,7  Td2 75         
 Td4 Td2,3 Tv3 Td4 All 100 Td3 75 Tv3 11       
Wg Pcd3,6,7, Pcd3,6,7,    Pcd3,6,7, 10   
 10-13,   10-13,      10-13, 10     
 16-19   16-19      Pcd16-19 90     
 Ppd1,3,4,   Ppd1,3,4,      Ppd1,3,4, 10     
 6,7,9   6,7,9      6,7,9 10     
 Dd1,7,8   Dd1,7,8      Dd1,7,8 45     
 Td4   Td4 All 100     Td4 35     
Svp-lacZ Pad1,7,8,  Pcv1,3, Pad1,7,8,    Pcv1 85 n.d.  n.d.  n.d.  
 15  6,7,9 15    Pcv3 18       
 Pcd2,4,6,   Pcd2,4,6,    Pcv6 55       
 9,18,21   9,18,21    Pcv7 85       
 Ppd3,9,15,   Ppd3,9,15,    Ppv2 25       
 16,18,20  Ppv2 16,18,20    Pcv9 100       
        Ppv2 18       
  Dd1    Dd1 90 Dv2 27       
 Dd3,6,7,8,  Dv2-8 Dd3,6,7,8,    Dv3,6 82       
 13   13    Dv4,8 35       
 Td6,8   Td6,8    Dv5 15       
   Tv2  All 100   Dv7 9       
        Tv2 25       
Ato Ppd19  Ppd19   Dv1 25 n.d. n.d.  n.d.   
 Dd9,11,  Dv1,3 Dd9,11,    Dv3 5       
 12,13   12,13 All 100           
Wild type*
vnd-
sca-vnd
divd%i%v%d%i%v%
Msh  − −     Dv2 23   −  −  
        Dv3 82       
        Dv4 35       
        Dv5 15       
 Dd2-13   Dd2-13 100 Dd1 91 Dv6 80 Dd2-13 0     
        Dv7 9       
        Dv8 30       
 Td4-8   Td4-8 100 Td2 75 Tv1,4 5 Td4-8 0     
        Tv2 25       
        Tv3 15       
        Tv5 30       
ind − (Ppd6,9,13 Pcd7,13) − −  (Ppd6,9,13 Pcd7,13) All 100 −  −  2-3 PCNBs  −  
  Dd1    Dd1 0     Dd1 92   
  Td1-3    Td1,2 0     Td1-3 0   
      Td3 85         
Ey Pad7  Pcv6 Pad7    Pcv6 55 Pad7    Pcv6 100 
 Pcd2,14  Pcv7 Pcd2,14    Pcv7 95 Pcd2,14    Pcv7 100 
 Ppd12,18,  Pcv9 Ppd12,18,    Pcv9 100 Pcd12,18,20    Pcv9 100 
 20  Ppv2 20    Ppv2 35     Ppv2 55 
 Dd4 Td1 Dv6 Dd4  Td1 0 Dv6 0 Dd4  Td1 0 Dv6 100 
  Td2 Dv7  All 100 Td2 40 Dv7 10  All <5 Td2 0 Dv7 20 
Dac Pcd1,2,4, − Pav1 Pcd1,2,4,  −  Pav1 100 Pcd1,2,4,  −  Pav1 40 
 6,8,9,14  Pcv7 6,8,9,14    Pcv7,9 100 6,8,9,14 <20   Pcv7 100 
 Ppd1,9,11  Pcv9 Ppd1,9,11    2-4 PCNBs  Ppd1,9,11 <20   Pcv9 100 
   Tv2  All 100   Tv2 25 Pcd2 100   Tv2 95 
Ems Ppd2,5,8 − Pcv5 Ppd2,5,8    Pcv5 15 Ppd2 30 −  Pcv5 88 
          Ppd5 0     
          Ppd8 20     
 Dd3,6,8  Dv3 Dd3,6,8  Dd1 80 Dv3 85 Dd3 12   Dv3 100 
        Dv2 20 Dd6 87     
    Td6    Dv6 70 Dd8 92     
 Td6    All 100   Tv2 25 Td6 0     
Lbe  − Pcv8   −  Pcv8 0 1-6 PCNBs  −  Pcv8 100 
 Dd7  Ppv3 Dd7    Ppv3 0 Dd7 40   Ppv3 100 
 Td4   Td4 All 100     Td4 0     
En Ppd5,8  Dv8 Ppd5,8    Dv8 30 Ppd5 75     
 Dd5  Tv4,5 Dd5    Tv4 5 Ppd8 30     
 Td5 Td3  Td5  Td3 90 Tv5 30 Dd5 25   Dv8 75 
     All 100     Td5 100 Td3 100 Tv4,5 100 
Gsb-d Ppd3,10   Ppd3,10      n.d.  n.d.  n.d.  
 Dd5,7   Dd5,7  Td2 75         
 Td4 Td2,3 Tv3 Td4 All 100 Td3 75 Tv3 11       
Wg Pcd3,6,7, Pcd3,6,7,    Pcd3,6,7, 10   
 10-13,   10-13,      10-13, 10     
 16-19   16-19      Pcd16-19 90     
 Ppd1,3,4,   Ppd1,3,4,      Ppd1,3,4, 10     
 6,7,9   6,7,9      6,7,9 10     
 Dd1,7,8   Dd1,7,8      Dd1,7,8 45     
 Td4   Td4 All 100     Td4 35     
Svp-lacZ Pad1,7,8,  Pcv1,3, Pad1,7,8,    Pcv1 85 n.d.  n.d.  n.d.  
 15  6,7,9 15    Pcv3 18       
 Pcd2,4,6,   Pcd2,4,6,    Pcv6 55       
 9,18,21   9,18,21    Pcv7 85       
 Ppd3,9,15,   Ppd3,9,15,    Ppv2 25       
 16,18,20  Ppv2 16,18,20    Pcv9 100       
        Ppv2 18       
  Dd1    Dd1 90 Dv2 27       
 Dd3,6,7,8,  Dv2-8 Dd3,6,7,8,    Dv3,6 82       
 13   13    Dv4,8 35       
 Td6,8   Td6,8    Dv5 15       
   Tv2  All 100   Dv7 9       
        Tv2 25       
Ato Ppd19  Ppd19   Dv1 25 n.d. n.d.  n.d.   
 Dd9,11,  Dv1,3 Dd9,11,    Dv3 5       
 12,13   12,13 All 100           

Percentages indicate presence of marker in vnd— or sca-vnd (n=16-30 in each case).

Bold indicates marker expression less than 90%.

Bold italics indicate ectopic gene expression.

PCNBs, protocerebral NBs;—, marker gene is not expressed; n.d., not determined; d, dorsal; i, intermediate; v, ventral.

*

In wild type, marker genes are expressed in respective NBs always to 100%.

Position of ocular ind domain is exceptional to other inddomains; it is unclear whether descending Ppd6,9,13, Pcd7,13 represent intermediate NBs.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal